Os primeiros registros que temos do basquete no clube vêm dos tempos do Germania, 1928, quando a atividade foi interrompida por falta de quadras adequadas. Na década de 1930 o Germania inscrevia equipes infantis e juvenis de "bola ao cesto" no Troféu Germania disputado nas Olimpíadas Infantis.

Em 1940 o clube estreou no campeonato oficial pela Segunda Divisão sob a direção de Marcelo Dreyfuss, conseguindo um 2º lugar. Logo passou a disputar também o campeonato da primeira divisão, o feminino, juvenil e infantil. Nos anos seguintes, sua posição oscilou muito entre a primeira e segunda divisão até que em 1948 disputou o Campeonato Principal dando início a um período de grandes glórias para o clube.

Na década de 1950, sob a orientação do treinador Serafim Cruz, o basquete feminino foi destaque no cenário esportivo paulista e brasileiro com jogadoras que se tornaram conhecidas internacionalmente. Podemos destacar alguns nomes como Iracema Ferreira, Yolanda Ferraz (Yola), Wanda Regulski, Maria Aparecida Guimarães (Cida), Nair Kanawatti e Zilda Ulbrich, a famosa Coca, que em 1957, durante o Campeonato Mundial no Chile foi considerada a segunda melhor jogadora do mundo.

Nessa época, não havia patrocínio ao esporte e até mesmo os uniformes eram confeccionados pelas próprias jogadoras.

Em 2005 o Pinheiros voltou a disputar as categorias femininas contando, em 2006, com 3 equipes que disputam os Campeonatos Oficiais da Federação.

Atualmente o basquete do Pinheiros tem sua força de trabalho nas categorias de base disputando sempre todos os Campeonatos Oficiais da Federação desde a categoria Pré-mini até adultos, com a conquista de diversos títulos, mantendo também equipes fortes nos Campeonatos da União de Veteranos do Brasil.